系統黑客松是兩天一夜的活動，以創新、目標明確之軟硬體優化主題，利用軟、硬體各種技術來改善系統效能、耗能、程式大小、反應速度等系統參數。透過競技方式激發學生軟硬體程式撰寫的熱情。
第一屆系統黑客松活動已在2016年9月於惠蓀林場順利舉行，該活動吸引了約50位來自台大、交大、清大、成大、中正、中興、雲科大、逢甲等學生報名，並組成13支隊伍，在不指定題目的前提下以 GPGPU 為主的異質多核心環境針對 13 個不同議題進行系統效能改善，並以連續 24 小時黑客形式完成，學生對該活動給予了高度評價，活動成果也反映學生對該活動有強烈的興趣及求學態度。
本屆系統黑客松活動採用「定題」及「不定題」兩種競賽形式。所謂「定題」即在限定題目下，針對特定開發平台(參賽者自選)，利用軟、硬體各種技術來改善系統各層面的問題；「不定題」則由參賽者發揮創意，在限定開發平台中，以軟、硬體技術實作出其構想。各組別內隊伍相互競爭。
定題競賽分為「MorSensor平台」組與「自選平台」組，主題分別為「三維室內定位」與「行人偵測」；不定題競賽則為「ARMmbed平台」組。報名參賽團隊需繳交參賽計畫書，通過審查者即可向主辦單位借用開發硬體平台(或自備開發硬體平)，並開始進行開發。黑客松當天(3/18)，定題競賽組之參賽者將取得特定測資，可在24小時內對其已開發之軟、硬體再進行優化；不定題競賽組則須在當天先發表成果，其後可在20小時內對其已開發之軟、硬體進行修改或優化。
